Реалм

Материал из Dasplus

Реалм /Realmo/

Рувики

https://ru.ruwiki.ru/w/index.php?title=Реалм Реалм. В вирусологии реалм (также сфера или империя) — это высший таксономический ранг, созданный для вирусов Международным комитетом по таксономии вирусов (International Committee on Taxonomy of Viruses, ICTV), который курирует работу над таксономией вирусов. Признаны шесть реалмов вирусов, они объединены специфическими высококонсервативными признаками:

  • Adnaviria, который содержит архейные нитчатые вирусы с геномами двухцепочечной ДНК A-формы, кодирующей уникальный альфа-спиральный главный капсидный белок;
  • Duplodnaviria, который содержит все вирусы с двухцепочечной ДНК, кодирующие главный капсидный белок HK97-fold;
  • Monodnaviria, который содержит все вирусы с одноцепочечной ДНК (оцДНК), кодирующие эндонуклеазу суперсемейства HUH, и её потомков;
  • Riboviria, в который включены все РНК-содержащие вирусы, кодирующие РНК-зависимую РНК-полимеразу, и все вирусы, кодирующие обратную транскриптазу;
  • Ribozyviria, который содержит дельта-подобные вирусы гепатита с кольцевыми геномами negative-sense ssRNA;
  • Varidnaviria, который содержит все вирусы с двухцепочечной ДНК, которые кодируют основной капсидный белок с вертикальным желеобразным рулетом.

Ранг реалма соответствует рангу домена, используемого для клеточных организмов, но отличается тем, что вирусы в реалме не обязательно имеют общего предка, то есть общего происхождения, и реалмы сами по себе не имеют общего предка. Вместо этого реалмы группируют вирусы на основе определённых признаков, которые сохраняются с течением времени. Эти признаки могут быть приобретены в ходе одного или нескольких событий. Хотя исторически было трудно определить глубокие эволюционные связи между вирусами, в 21 веке методы метагеномики и криогенной электронной микроскопии, позволили провести необходимые исследования, что привело к определению реалма Riboviria в 2018 году, трех реалмов в 2019 году и двух в 2020.

Наименование

В документах ICTV высший таксономический ранг вирусов называется realm, с англ. — «королевство», «царство». Устоявшегося русскоязычного термина для этого ранга нет. Евгений Кунин предлагает вариант «империя»[1], предложен вариант «сфера», также англоязычный термин может транслитерироваться[2].

Названия реалмов состоят из описательной первой части и суффикса -viria[3]. Первая часть наименования Duplodnaviria означает «двойная ДНК», в этот реалм входят вирусы с двухцепочечной ДНК[4], первая часть наименования Monodnaviria означает «одинарная ДНК», в этот реалм входят вирусы с одноцепочечной ДНК[5], первая часть наименования Ribozyviria берется из названия рибонуклеиновой кислоты (РНК)[6], а первая часть наименования Varidnaviria буквально означает «различная ДНК»[7]. Для вироидов используется суффикс -viroidia, а для сателлитов суффикс -satellitia[3], но по состоянию на 2019 год ни вироидные, ни сателлитные реалмы не выделялись[8].

Содержание доступно по лицензии (CC BY-SA 4.0)

Источник — https://dasplus.ru/index.php?title=Реалм&oldid=3457